据《北京青年报》报道，中国足协在完成换届工作后，按照“13部门＋2公司＋1基地”的模式完成内部机构整合，中超、中甲、中乙联赛未来大概率将统一由职业联赛公司负责运营。
《北京青年报》记者 透露，在本轮换届之前，中国足协是按照“18＋1＋1＋1”的模式设置组织架构的，也就是说足协下设18个职能部门。3个“1”分别指的是中国足协全资子公司福特宝公司、香河国家队训练基地和中足联筹备组（中超公司）。此外，与足协内部管理架构产生交集的还有相对独立的全国足球发展重点城市工作领导小组办公室（简称足城办）。
值得注意的是，自从2020年5月开始，中国足协开始有意识地精简内部机构，这是因为在此之前的2年时间里，足协累计设立了多达28个职能部门。也正是因为各部门职能划分过于细化，多个部门之间产生了业务交集甚至重叠的问题，加剧了相关工作落实的复杂程度，并影响工作效率。中国足协推动本轮内部机构调整，也是为了提升业务工作效率与质量。
据了解，根据方案，未来中国足协将下设13个职能部门，分别党办、纪检监督、媒体公关、行政、国际交流、国家队管理、男足青训、女子足球、裁判、竞赛、技术、社会足球、信息管理等部门。原五人制及沙滩足球部、场馆部、会员协会部、财务部、战略规划部等部门将被取消，其原有职能将分别划拨给社会足球、竞赛部、行政部等部门。
此外，除福特宝公司、香河基地外，中足联筹备组未来何去何从的问题也备受各职业足球俱乐部的关注。据了解，在中足联能否最终挂牌成立暂无定论的情况下，未来中超、中甲、中乙三级职业联赛的运营大概率将由全新成立的“职业联赛公司”来具体操作。也就是说，中足联筹备组接下来有可能面临更名，并以“公司”性质参与三级职业联赛的运营。
在此之前，中国足协与有关方面在沟通的过程中，曾提出成立“中国职业足球联赛运营公司”或“中国足球职业联赛联合公司”。不过“公司”最终如何命名，其职能与权益范围如何规定，仍有待各方进一步商榷。